کما تولی رئاسة جامعة الامام الصادق (ع) وکان استاذا لمادة الاخلاق الاسلامیة فی هذه الجامعة.
وکان قبل انتصار الثورة الاسلامیة فی ایران عام 1979 من علماء الدین المناضلین ضد الحکم الملکی البائد وتعرض عدة مرات للاعتقال والتعذیب والسجن والنفی لنشاطاته السیاسیة والثوریة فی ذلک العهد.
وبعد الثورة کان واحدا من علماء الدین الخمسة الذین شکلوا النواة الرئیسیة لمجلس قیادة الثورة.
وعین بعد ذلک وزیرا للداخلیة (فی حکومة مجلس قیادة الثورة وحکومة الشهیدین رجائی وباهنر) ورئیس الوزراء بالوکالة (بعد اغتیال الشهیدین رجائی وباهنر).
وبعد مشارکته فی مراسم احیاء الذکرى السنویة لرحیل الامام الخمینی (رض) یوم 4 حزیران/یونیو 2014 اصیب بجلطة قلبیة نقل على اثرها الى المستشفى.
وکان آیة الله مهدوی کنی قد تلقى دراسته الدینی على ید علماء کبار بمن فیهم آیة الله الشیخ علی اکبر برهان والحاج الشیخ عبد الجواد سدئی (جبل عاملی) وصدوقی وسلطانی ومجاهدی ورفیعی قزوینی وشعرانی والعلامة طباطبائی وآیة الله بروجردی وآیة الله کلبایکانی والامام الخمینی.
وصدرت له مؤلفات عدیدة منها 'نقطة البدایة فی الاخلاق العملیة'، 'اصول ومبادئ الاقتصاد الاسلامی فی القرآن'، 'عشرون حدیثا' و'شرح دعاء الافتتاح'. کما صدرت مذکراته عن مرکز توثیق الثورة الاسلامیة.
وتولى آیة الله مهدوی کنی بعد انتصار الثورة الاسلامیة مناصب ومهام عدة بما فیها:
عضو النواة الاولیة لمجلس قیادة الثورة، عضو لجنة استقبال الامام الخمینی (رض)، مسؤول لجنة الثورة الاسلامیة (المعروفة باسم کومیتة بوصفها اول مؤسسة ثوریة تولت مسؤولیة حمایة الثورة)، احد الاعضاء الفقهاء فی مجلس صیانة الدستور (مرتان)، وزارة الداخلیة فی حکومتی الشهیدین رجائی وباهنر، رئیس الوزراء بالنیابة بعد اغتیال الشهیدین رجائی وباهنر، عضو لجنة الثورة الثقافیة، عضو المجلس الاعلى للثورة الثقافیة، عضو مجلس مراجعة الدستور، رئیس مرکز شؤون المساجد، عضو مجمع تشخیص مصلحة النظام، عضو مجلس خبراء القیادة ومن ثم رئیسه.